本发明公开了一种新型水稻 D-乳酸脱氢酶（OsD-LDH）及其编码基因与应用，属于植物生物工程领域。新型水稻 D-乳酸脱氢酶是细胞色素 C 依赖的 D-乳酸脱氢酶，其氨基酸序列如 SEQ?ID?NO.1 所示；该 D-乳酸脱氢酶编码基因的核苷酸序列如 SEQ?ID?NO.2 所示。本发明的 OsD-LDH 基因在植物体内参与胁迫条件下产生的丙酮醛代谢，可用于提高植物耐受逆境胁迫和培育高抗逆性植物。本发明的 OsD-LDH 基因还可以作为筛选标记，以丙酮醛或 D-乳酸作为筛选压力应用于转基因筛选中。本发明的 D-乳酸脱氢酶可用来培育高抗逆性的植物及用于转基因筛选，对增加农业生产及改进转基因方法具有重要的意义。